台北市議員爆料指出，北市聯醫招募文宣註明，約用住院醫師薪資十一萬元，但是實際上本薪只有五萬元，其餘就是各種加給或獎勵金，以致造成醫師加班費嚴重低估。台北市立聯合醫院二十二日對外澄清，媒體報導所稱招募文宣標榜住院醫師十一萬元，明顯跟正式公告內容不符，所有人力招募資訊，均應以院方徵才網站或其他公開徵才網站為主，院方強調住院醫師薪資制度合理。

北市聯醫指出，住院醫師所得組成包括「經常性薪資」及「獎勵金」兩部分。經常性薪資是指本薪、職級加給及生活津貼。住院醫師尚屬專科醫師訓練階段，院方為勉勵訓練期間持續精進臨床技能與專業知識，自年度醫療基金收支總淨餘數內提撥獎勵金，依其學習表現與臨床訓練成效核予發放。

北市聯醫進一步指出，因此，獎勵金性質並非勞務對價，而是院方針對訓練成效的肯定與勉勵。另外，院方進用住院醫師時，契約書中即明確揭示薪資結構，並且清楚說明獎勵金屬於預支性質。未來持續檢視相關人事制度合理性與適法性，並且視實際需要適時調整，以便兼顧人力招募、臨床訓練及醫療服務品質穩定。