台北市议员爆料指出，北市联医招募文宣注明，约用住院医师薪资十一万元，但是实际上本薪只有五万元，其馀就是各种加给或奖励金，以致造成医师加班费严重低估。台北市立联合医院二十二日对外澄清，媒体报导所称招募文宣标榜住院医师十一万元，明显跟正式公告内容不符，所有人力招募资讯，均应以院方徵才网站或其他公开徵才网站为主，院方强调住院医师薪资制度合理。

北市联医指出，住院医师所得组成包括「经常性薪资」及「奖励金」两部分。经常性薪资是指本薪、职级加给及生活津贴。住院医师尚属专科医师训练阶段，院方为勉励训练期间持续精进临床技能与专业知识，自年度医疗基金收支总净馀数内提拨奖励金，依其学习表现与临床训练成效核予发放。

北市联医进一步指出，因此，奖励金性质并非劳务对价，而是院方针对训练成效的肯定与勉励。另外，院方进用住院医师时，契约书中即明确揭示薪资结构，并且清楚说明奖励金属於预支性质。未来持续检视相关人事制度合理性与适法性，并且视实际需要适时调整，以便兼顾人力招募、临床训练及医疗服务品质稳定。