今年公費流感及新冠疫苗將於十月一日同步開打，接種疫苗為預防流感及新冠最好的方法，尤其流感及新冠病毒變異快速，每年流行病毒株有所不同，且去年或過去曾接種的疫苗保護力也已衰退，必須接種當年度新型疫苗才可獲得最佳的免疫保護。為配合二種疫苗校園接種作業，並使家長更方便簽署接種意願書，疾管署推出「疫苗接種行政電子化系統（NIAS）」，家長僅需掃描學校提供之流感及新冠疫苗QRcode，即可進入個別疫苗簽署頁面填寫相關資料與簽署意願。

在疫苗接種行政電子化系統（NIAS），橘色表單為流感疫苗，紅色表單為新冠疫苗，透過不同顏色輔助家長簽署時更易辨識；家長不需擔心遺失文件，且在意願書簽署期限截止前，隨時都可以修改接種意願。此外，電子化系統亦減少傳統紙本作業之不便及減輕學校行政負擔。如家長不於線上簽署，也可選擇紙本方式。

今年提供之公費四價流感疫苗依世界衛生組織選株結果，使用更換H3N2疫苗株為泰國株之新一季疫苗，與目前漸增且預期今年秋冬流行的H3N2病毒相吻合；另新冠疫情依目前監測資料，預估今年流行變異株將持續為JN.1系列（包括KP及LB等變異株系列），新一季公費新冠疫苗採JN.1疫苗株，可有效預防秋冬流行變異株之中重症威脅；二種公費疫苗均可針對流行流感及新冠病毒株提供最新的免疫保護，呼籲家長在接到校方通知後踴躍填寫兩種疫苗意願書，讓孩子在學校完成接種。

會提供五種公費流感疫苗供接種，是無法指定接種的廠牌，會由校方和衛生局視情況安排；發言人羅一鈞表示，五種廠牌的流感疫苗同樣安全有效，建議不用特別選廠牌。若接種當天不適合接種的話，校方也會提供補接種單，家長可自行帶孩子到醫療院所接種。有媒體詢問，校方或衛生局是否會在接種前告知接種的廠牌，對此，疾管署也表示，會由各地方縣市政府處理，沒有律定是否要先通知。