前民众党主席柯文哲妻子陈佩琪连续2日发文质疑南铁地下化照顾宅容积率合法，台南市政府除发声明严正驳斥，12日并召开说明会，都市发展局长林荣川拿出「南市铁路地下化照顾住宅VS北市京华城开发变更对照表」，强调南铁地下化照顾宅具「重大公益性、合理性、合法性」，而京华城开发变更是「商业开发案」，陈佩琪将二件完全不同的案子拿来对比，完全是「竹篙凑菜刀」、恶意扭曲，也强调政府照顾拆迁全部过程均依法行政，程序严谨，评选过程也完全公开透明，呼吁勿再以不实资讯抹黑攻击。

林荣川局长愤怒表示，南铁地下化对台南未来长远发展、都市风貌影响重大，市府同仁尽心尽力做到最好，外界对南铁地下化照顾宅恶意扭曲不仅伤害台南，对南铁照顾宅住户也相当不公平；他也说明照顾宅具备「公益性、合理性、合法性」三大要点，目的是为了照顾弱势拆迁户，并让南铁地下化重大工程得以顺利推动，采公有地公办都市更新「极具重大公益性」，而京华城开发变更案则是「商业开发案」，两案本质上完全不同。

因为铁路地下化，原本住的房子受到拆迁，必须有新的住所的南铁照顾宅住户温先生对陈佩琪发文内容表示不理解，强调为照顾拆迁户，政府和民间合作盖了照顾宅，让拆迁户以优惠成本价承购，和图利扯不上关系。

林荣川指出，该案使用的是全国适用的通案规定或规则，皆依都市更新条例及都市计画法等相关规定，容积率依法审核，完全合理、合法；总计申请50%容积奖励，基地法定容积为210%，最终设计容积结果为210%x(1+50%)=315%，完全符合法令规定，并非外界谣言538.4%，也请对方针对数字来处提出说明。