東吳大學法學院暨法律系專任教授葛克昌認為，稅法是憲法的一部分，其正當法律程序的要求比行政法要強十倍、百倍。他指出，無效的行為根本沒有時間的限制，自始無效，任何人都可以主張。太極門稅案就是自始無效，這個違反邏輯、重大的錯誤案件，事實上就是無效的行政處分。

臺灣財經刑法研究學會理事長陳志龍教授指出，太極門1996年的稅單就是「假稅單」。當初作偽證的稅務員史越生，沒有針對太極門稅務進行實質調查，沒有舉證，也沒有報經財政部核准，嚴重違反所得稅法第83條之1規定。稅務單位就直接照抄起訴書及市調處資料，最後做出六張假稅單，就是「六坨大便」。

會計師林光炫直指，太極門稅案起因於侯寬仁檢察官的違法偵查起訴，國稅局未依正常調查程序即開出稅單。所得稅法第83-1條立法時強調使用間接證明法課稅須報經財政部核准，否則屬重大明顯瑕疵，但國稅局未遵循此程序，應視為無效。依行政程序法第111條規定無效的行政處分具有重大明顯瑕疵，不能補正。前財政部賦稅署副署長許春安在其任內曾表示，國稅局未報經財政部核准，不能補正。