0121楠西地震发生至今，台南市政府工务局积极处理红、黄单危险建筑物紧急评估、损坏评估、补助审核等相关事宜，市府并成立「震灾复原联合服务中心」，提供受损户相关即时资讯；工务局表示，自3月13日首笔补助款入帐迄今，受理修缮或拆除重建补助603件，自3月13日首笔辅助款入帐至今已核拨344件，件数近六成，拨款金额逾1亿元，也提醒尚未申请的民众尽速申请。

南市工务局指出，震灾红、黄单补助金额由建筑师、土木技师及结构技师等三大专业公会现勘，总计房屋损坏评估4122件建筑物，损害评估受理1983件，已全数完成，陆续寄出评估报告、修缮或拆除重建补助金额及补助申请书；为便利灾民就近申办，市府采「单点申请，专人送件」的机制，可让民众免於四处奔波申请各式佐证文件，提醒尚未申请的民众尽速带著申请书、身分证影本、金融机构存摺影本、损害评估报告正本、领据、建物权利证明文件及切结书等资料向所在地区公所申请。

工务局也进一步说明，为扩大灾後照顾范围，加速建筑物内附属设施、设备修缮，包括水管破裂、天花板、门窗、化粪池毁等，减少民众生活不便，市府即将公告「一般住宅建筑物灾损修缮救助金实施计画」，只要区公所有紧急通报列册的都可以申请修缮补助。

工务局强调，此次地震也震出「大楼软脚虾」问题，玉井文化大厦於地震中受到相当严重损害，为让30间住户能够尽早返家，工务局28日也举办震後复原方案说明会，邀国震研究中心、国土署等派员说明，希望能够以0206及0403等地震案例，向住户说明「弱层补强」好处，提供专业建议，协助住户以最快速的时间，早日重返家园。