最高法院於民國96年7月13日已判決確定太極門案無罪、無稅、無違反稅捐稽徵法；受冤枉羈押的全部被告均獲得國家冤獄賠償。經監察院調查，承辦檢察官侯寬仁涉犯八項重大違法，被移送法務部要求從嚴究責議處，並將本案列為重大人權保障案件；而監察院也調查國稅局，詳列七項重大違法。

前高等法院法官兼庭長兼審判發言人，同時也是太極門刑事案件二審審判長溫耀源曾公開表示，當時基於無罪推定原則判定太極門無罪，對於檢察官起訴的詐欺，合議庭一一查明，最後判決無罪；而違反稅捐稽徵法的部分，也查明當事人收受敬師禮，沒有不正當方法逃漏稅捐，所以也判決無罪，並認為敬師禮是贈與。判決書已詳細論述起訴書的不可採，國稅局不依據法院三審確定的結果，卻還拿檢察官的起訴書為課稅依據，簡直匪夷所思。

國際關注太極門遭枉法裁判 台灣民主轉型尚未完成
2024年9月20日由新興宗教研究中心（CESNUR）和人權無國界組織（HRWF）定期舉辦的太極門案件網路研討會中，人權無國界組織共同創辦人暨主席Willy Fautré提到，專制政權轉變為民主政權從來都不是一朝一夕的事。法律可以更改，但思想的改變需要時間，而且並非所有這樣的轉型都能成功，因為許多舊制的威權主義仍在運作著。台中高等行政法院的不公義判決，證明了台灣的民主轉型尚未完成。

在號稱民主燈塔的台灣，政府應勇敢面對錯誤，司法更要落實兩公約，給人民真正的有效救濟。太極門弟子一再呼籲政府，儘速平反太極門假案，返還被違法拍賣的土地，嚴懲違法官員，還給人民遲來的正義，也還給人民真正的司法正義與真正的民主法治。