太極門案受到國際關注，凸顯轉型正義的重要，暴露台灣法治殘留威權遺毒，導致長達28年的人權迫害。另一方面，凸顯國稅局少數官僚綁架政府，行政權霸凌五院的弊病。經監察院調查，承辦檢察官侯寬仁涉犯八項重大違法，被函送法務部從嚴究責議處，並將本案列為重大人權保障案件，而監察院也調查國稅局，詳列七項重大違法。

28年了，國稅局從來沒有舉證太極門是補習班的證據，國稅局開出的六個年度違法課稅，其中80、82~85年共五個年度都已更正為零，相同事證的81年度卻被認定為補習班，如此荒誕且明顯的重大錯誤，國稅局與執行署竟仍泯滅良心，貪圖獎勵金，執意強制執行、違法拍賣，硬生生將掌門人苦心準備多年，計畫作為弟子修行道場的苗栗土地收歸國有，與盜匪何異？
從事稅務行政救濟實務工作十幾年經驗的王健安律師指出，稅法案件最重要的一個關鍵就是事實的認定；太極門稅案新事實新證據出現的時間點明確，又於事實認定有關鍵的效力，這樣明顯的證據，在稅捐實務上非常難見，但法院仍然選擇視而不見，這有極大的法律爭議！王健安認為，太極門案應該要成為台灣稅務及司法改革的標竿，它不是代表人民贏了，國家輸了；而是代表人民平反了，國家進步了！

太極門義務訴訟代理律師黃麗蓉提到，前大法官黃虹霞公開向蒙冤27年始獲平反的王瑞豐道歉並表示，法官是人而不是神，也可能犯錯，黃虹霞說如果她是法官，做了錯的判決，會很希望有人補救，讓她不至於錯到底。黃麗蓉感到遺憾及憤慨，台中高等行政法院未能本於良心，公平審理此案，全球太極門弟子同聲譴責，不容許執行公權力者違背證據法則，迫害宗教信仰自由。太極門全球弟子必會堅持真相到底，依法上訴，相信最高行政法院必能正確的認事用法，還太極門應有的公道與正義。